1925年夏，赴北京任清华大学教授。1928年8月，出版散文集《背影》，在文坛引起强烈反响，并以平淡朴素而又清新秀丽的优美文笔独树一帜。同年11月26日，其夫人武钟谦在扬州病逝，对他打击很大。

　　1931年4月，结识陈竹隐女士，同年8月赴欧洲进修和游历。1932年7月回国后写成《欧游杂记》，仍任清华大学教授，同年8月与陈竹隐结为伉俪。1934年后参与《文学季刊》杂志编辑工作。

　　1937年，抗日战争爆发，随校南迁至长沙、昆明、蒙自、成都，任长沙临时大学、西南联大教授。这一时期曾写过散文《语文影》，与叶圣陶合著《国文教学》等书。

　　抗日战胜利后，积极支持昆明学生反对国民政府发动内战。1946年，由昆明返回北京，任清华大学中文系主任。7月，著名的民主战士李公朴、闻一多被国民政府特务暗杀，他不顾个人安危，出席成都各界举行的李、闻惨案追悼大会，并报告闻一多生平事迹。1946年10月，他从四川回到北平，11月担任“整理闻一多先生遗著委员会”召集人。

　　1948年6月18日，他身患重病，仍签名《抗议美国扶日政策并拒绝领取美援面粉宣言》，并嘱告家人不买配售面粉，始终保持着一个正直的爱国知识分子的高尚气节和可贵情操。8月12日11时40分，病逝于北平，享年51岁。毛泽东曾称赞他“一身重病，宁可饿死，不领美国的‘救济粮’的‘骨气’，表现了我们民族的英雄气概”。

　　朱自清一生勤奋，共有诗歌、散文、评论、学术研究著作26种，约二百多万言。遗著编入《朱自清集》、《朱自清诗文选集》等。

　　朱自清病逝后，安葬在香山附近的万安公墓，墓碑上镌刻着“清华大学教授朱自清先生之墓”。1990年，其夫人陈竹隐去世，与先生合葬在一起。