武宗死，世宗立，改年号为嘉靖元年(1522年)。之鸾上疏揭发太监弄权，蒙蔽武宗，损害朝廷利益，建议世宗广开言路，起用正人，罢黜奸佞，并极力指陈前朝的积弊。世宗虽心知所言是实，但因初即位，一时未能拨乱反正。之鸾终因忤触权贵，降职出任崇德丞，又先后改任长兴令、青州同知。因母逝，回籍奔丧，后转任南京刑部郎中。嘉靖八年，改任陕西宁夏佥事。时关内大旱，灾民苦不堪言，他关心民之疾苦，并上报皇帝。

　　宁夏是古代北方边防，从红山堡的黑水沟到定边的南山口、花马池一线，原有堡垒，因年久倒塌。该地是砂碛区，少土缺水，先后驻守官员，都因修不好城堡犯罪丢官。之鸾当初任佥事时，曾因这事劾过王琼，现王琼任总兵镇守榆林，他调任后正是王的下属。王要报旧怨，特向朝廷荐之鸾负责在花马池建城堡，以此来刁难之鸾。之鸾慨然接受，勘好地势，便带领军工先行抛沙，深挖丈余，得到粘土;同时于百里外山下开凿泉水，用木枧引水到工地，供工程使用。原限5个月完工，只施工3个月，即将城堡筑牢，并让功给王琼。王琼由衷地佩服。从此，宁夏一带边境，有坚固城堡做屏障，边防的安全得以确保。巡抚胡东皋，赞赏其才能，向朝廷推荐之鸾接替自己的职务。

　　此后，齐之鸾从宁夏还京，调任河南省副使，并兼任该省提学副使。不久，改任山东临清兵备副使，后又被召回任顺天府丞，未及动身，境内发生盗乱，留下镇抚。平息后，提升为河南按察使，于嘉靖十三年(1534年)卒于任上，时年52岁，卒后列入乡贤祠奉祀。

　　齐之鸾学识渊博，文彩宏丽，对桐城派的兴起有先导作用。姚莹在《桐旧集》序中曰：“自齐蓉川(之鸾)给谏以诗著有明中叶，钱田间(钱澄之)振于晚季，自是作者如林。”齐之鸾著有《蓉川集》、《南征纪行》和《入夏录》等各若干卷。他的诗歌直面现实，出语新奇，是当之无愧的桐城派诗祖。