第8集 黄河水灾肆虐京城霍乱横行

　　郑齐知道自己口不择言得罪了允贤，又不知道该怎样向允贤赔礼道歉，于是托静慈师太将一套银针转交给允贤，银针可以帮助允贤给庵内的病人治病，郑齐希望能借此让允贤心里舒畅些。允贤听静慈师太说起郑齐自幼失去生母，其母是一个同允贤一样懂得许多医术的女子，因此郑齐对允贤格外有一种亲近感，允贤顿时觉得他与郑齐都自幼丧母也算同病相怜。为了给郑齐回礼，允贤亲自做了桂花蜜送给郑齐，郑齐高兴不已。黄河发大水，二十四县受灾，灾情严重。因为发大水而流离失所的灾民来到永庆庵请求静慈师太收留，静慈师太将他们收留庵中，一部分灾民身体不适，允贤见他们的病症多为眼窝深陷，腹泻呕吐，秽物还如同水一样，初步诊断这些灾民是感染了霍乱。霍乱是大疫，静慈师太将情况传递给有关部门希望得到更加妥善的应对。太医院亦快速判断出流民中霍乱病症横行，并果断将大量流民集中到太医院进行诊治。京城百姓得知城中流民感染霍乱，都到药铺疯抢治泻肚子的药材。顺天府的人为了片面安抚城中百姓，竟下令关城门，阻止流民进入城中避难，允贤义父于东洋于大人极力阻挠，但亦无济于事，关键时刻，皇上赶到现场，当众杀死滥杀百姓的官兵，下令开城门迎接百姓，并命于东洋统筹治理黄河水灾。惠民药局的人到永庆庵帮忙，万宁见允贤给病人治病的法子有违寻常医理，遂与允贤辩论，辩论之余，万宁认出紫苏曾将他带到公堂之上使他遭受非议，而允贤虽然已做男儿打扮，亦惊惧万宁识出自己，幸好静慈师太及时出面打断二人的谈话，但事情并没有就此结束。

　　第9集 祈镇重挫太后拿到玉玺

　　朝堂之上，几个小官“供认”黄河毁堤之事确是受太后指使，太后反驳，说皇上让几个鸡毛小官诬陷于她，于是皇上命人将范弘——这个太后最倚重的太监带上殿来，并将范弘认罪画押的供纸放到太后面前，太后无可辩驳，但范弘大喊自己是屈打成招，后气绝，死前喊冤，百官也心存疑虑，但仍有众多官员支持皇上。皇上通过“毁堤事件”几乎扳倒太后，拿回玉玺，到永庆庵向静慈师太“报喜”，并带来大量医治霍乱的药材，但静慈师太一眼就看出皇上此行还另有心思。郑齐正与允贤聊天，小厮前来报告其夫人得知他前往重疫区，心急如焚，催他回去，允贤因此而知道郑齐已经成婚。万宁对允贤怀有偏见，故意道出允贤的女子身份，灾民因此而误解允贤，不但不感激允贤的救命之恩，反而将她指作医婆，大加唾弃，不愿再让允贤医治，允贤百口莫辩。而这时来路不明的“朝鲜商人”(瓦剌人)却愿意让允贤医治，但惠民药局的人却针对允贤不肯给让允贤抓药，无奈之下，允贤就地取材制成偏方，竟真的治好了“朝鲜商人”。灾民知悉此事，又一窝蜂地去请允贤为他们诊病，允贤面对大起大落，不骄不躁，说惠民药局的大夫医术高明，也一定能治好大家的病，于是一半灾民又自动分流到惠民药局的大夫们那边去，这些大夫们也因此对允贤有所改观。允贤煎药时扇子着了火，差点烧到自己，万宁及时提醒允贤当心，并为自己曾经误解针对允贤道歉，还虚心向允贤讨教治病“偏方”，二人自此化干戈为玉帛。祁钰受皇上诏令运送粮食进京赈灾，并临时调整计划率先送粮食到永庆庵救急。听说永庆庵外有一位公子正在分发粮食，紫苏和允贤以为是郑齐又来输送物资，遂跑去看看热闹，到了之后，才发现原来这次来的是朱公子朱祁钰，祁钰见允贤戴着他送的珠花，心内欢喜。祁钰与允贤约定再见，并将自己的随身香包赠送给允贤。面对祁钰和郑齐两个人分别赠送的香包，允贤将郑齐送的香包收进了柜子，而将祁钰的香包拿在手中，少女情怀悸动着。